细菌的三种基本形态是：球状、杆状、螺旋状 。
球状：这类细菌称为球菌，细胞呈球形或近似球形。根据其分裂方向和分裂后排列方式的不同，又可分为单球菌（如尿素小球菌）、双球菌（如肺炎双球菌 ）、链球菌（如溶血性链球菌）、四联球菌（如四联小球菌）、八叠球菌（如藤黄八叠球菌）和葡萄球菌（如金黄色葡萄球菌）等。
杆状：杆菌是细菌中种类最多的类型，细胞呈杆状或圆柱状。不同杆菌的长短、粗细差异较大，有的杆菌菌体较短，近似椭圆形，称为球杆菌；有的杆菌两端平齐，如炭疽芽孢杆菌；有的杆菌两端尖细，如梭杆菌；还有的杆菌末端膨大呈棒状，如白喉棒状杆菌 。
螺旋状：螺旋状的细菌称为螺旋菌，根据其弯曲程度不同可分为弧菌和螺菌。弧菌的菌体只有一个弯曲，呈弧形或逗号形，如霍乱弧菌；螺菌的菌体有多个弯曲，较为坚硬，呈螺旋状，如鼠咬热螺菌。