剥开皮的皮蛋常温下可以放两个小时左右，如果是没有剥开皮的可以存放三个月左右的时间。需要注意的是皮蛋不宜放置在冰箱中保存，低温条件会影响松花蛋的风味和色泽，使其品质变差。
如果有吃不完，需要保存一段时间的皮蛋，可以放在塑料袋里面，密封保存。一般情况下，未剥开的皮蛋应放在温度相对较低的通风避光处，但时间不宜过长，不般不应超过三个月时间。但剥开的皮蛋保质时间只有两个小时，应尽快食用，不可留存到下次餐食用。
皮蛋是由碱性物质浸泡而成的，成胶状体，含水分约70%左右。若经过冷冻，水分就会逐渐结冰。此时将松花蛋拿出来吃，冰会逐渐融化，其胶状体就会变成蜂窝状，改变了松花蛋原有的醇厚清香的风味，降低了食用价值。而且低温会使松花蛋色泽变黄，口感变硬，同正常的松花蛋差异极大。所以，皮蛋并不适合放在冰箱里储存。