附着物体积应占水族箱总水体的20% 左右，而且需有充分的水流经过，不可形成死角，出现缺氧区。接下来就可以培养硝化细菌了。
硝化细菌一般不需要特殊接种培养,运转正常的水族箱附着物上会自然生长出硝化细菌,在淡水水族箱中培育出成熟的硝化细菌需要1~2 周的时间,海水水族箱约需要1个月。硝化细菌在没有氨氮的情况下生长量是很少的，如此时放人大量的鱼，则硝化细菌无法承担分解氨氮的工作，因此在培养硝化细菌时必须在水中添加氨氮，以刺激其大量生长。庭中使用的方法是先放入少量的鱼，待硝化细菌成熟后再逐步增加放鱼的数量。如急需使用大量的硝化细菌，也可采用接种的方式,放入一些市汤上出售的硝化细菌成品，可在5 天内建立起一个良好的生态系统。
硝化细菌是一种好氧性细菌，一般情况下培养硝化细菌用不了多长时间，它可以长期不断繁殖，培养时要保证水分和养分。硝化细菌主要有液体硝化细菌、白棉硝化细菌、干粉硝化细菌三种繁殖方法。
干粉硝化细菌属于最安全也是最慢的一种方法，硝化细菌分为亚硝酸菌和硝酸菌两种。两种细菌的主要区别是硝酸菌的生长速度来区分，硝酸菌要比亚硝酸菌速度慢，培养硝化菌的前提是保证水分和氧气的充足。一般在鱼缸中硝化细菌一周左右就可以成功建立菌落，海水水族箱则需要一个月才能培养出，这与其中的盐分有着密切的关系，培养过程中要注意除氯和增加氧气，不需要开杀菌灯。
一般情况下培养硝化细菌使用不了多长时间，它可以长期不断繁殖。硝化细菌适宜的温度是二十三度到二十八度，温度升到二十五度的时候属于繁殖高峰期，平时可以把鱼缸温度控制在二十五度左右，这样会更快的培养出硝化细菌。如果温度比较低或者偏高会导致活性下降，繁殖力相应折扣，同时要为硝化细菌准备好附着物。多孔、面积大的材料为首选，硝化细菌也要吃菌粮，市场上或者网上都有卖硝化细菌的“粮食”，比如新鲜的酸奶，硝化细菌的粮食也就是氨氮，都可以直接购买。很多人在培养硝化细菌的时候都以失败告终，一部分原因可能是因为鱼的数量太多，超过了硝化细菌的处理能力，造成系统失去平衡。如果新手刚开始培养硝化细菌，可以到养鱼的朋友邻居家里拿一些鱼缸里面的白棉，放在自己的鱼缸里面，这样可以促进硝化细菌的培养。