“生理性腹泻”既然是母乳原因造成，解决的根本办法就是换奶。这样的孩子如果改吃牛奶或其它乳品，一般都能奏效。药物治疗一般不能解决根本问题。“生理性腹泻”的婴儿并不影响其生长发育，相反比一般孩子长得还要胖些。那么还有没有必要换奶呢?婴儿吃奶的目的只有一个，就是供给身体所需要的营养物质，以维持其机体正常功能和生长发育。排便的意义在于既能保证营养，又能够排除消化道内的废物。从这两点讲，“生理性腹泻”婴儿是完全能够达到的。.因此一般讲，完全可以不必因为大便次数多些就舍弃母乳、改换牛奶或其它乳品喂养。
对于“生理性腹泻”患儿一般也无需药物治疗。治疗腹泻药物不外乎抗感染、收敛、助消化药以及维生素等。这些药物对于“生理性腹泻”婴儿，一般都没有多大益处。因为这类孩子既无消化道感染，也没有消化不好。既然做不到对症下药，便没有用药物治疗的必要。
“生理性腹泻”婴儿的唯一危害是大便次数多造成的麻烦。除给家长增加换尿布的负担外，如果不能及时换尿布和清洗臀部，还可能引起臀红，甚至局部感染。对这类孩子每次换完尿布都应洗净臀部，并用消毒油膏(如鞣酸软膏)涂抹，以保护局部皮肤。
对“生理性腹泻”患儿要加强护理，防止在“生理性腹泻”基础上发生“病理性腹泻”。如果大便次数突然增加，大便内水分增多，有臭味，这很可能由于其它因素加重了腹泻。应该寻找其原因，去除造成腹泻的新因素，必要时应用药物治疗，直到恢复到平日情况为止。如果年轻的爸爸妈妈不能区分宝宝是生理性腹泻还是病理行腹泻的时候，我们应该带宝宝到附近医院咨询医生，检查化验，而不可私自给宝宝吃一些常规的止泻的药，当然大人用的止泻药不可以随便给孩子吃。小宝宝腹泻原因很多的，最好将宝宝的大便送医院化验一下，确定一下致病原因，确诊后对症施治。对于婴儿生理性腹泻，调整宝宝饮食是关键，而且，因为宝宝吃的是母乳，母亲的饮食习惯对于宝宝有一定的影响，所以，作为母亲也应该调整饮食习惯。
