《最强大脑》是江苏卫视引进德国节目《Super Brain》而推出的大型科学竞技真人秀节目。节目专注于传播脑科学知识和脑力竞技，主要目的是挖掘科学人才。节目全程邀请科学家，从科学角度，探秘天才的世界，并将筛选出的选手组成最强大脑中国战队，迎战来自海外的最强大脑战队，决出世界最强大脑。
节目播出前几季的时候口碑和收视率都不错，可是越到后来质疑的声音就越多，不少网友在看完节目之后，怀疑节目组为了节目效果故意作假，有背后操作节目的嫌疑，因为从一些节目效果来看，人为根本没办法达到。节目播出到后来，不仅有大批的观众质疑，连业内一些有名望的人士也开始质疑。
被外界称为中国雨人的周玮，以震撼人心的心算天赋，征服了无数观众。但同时，他那令人不可思议的超强脑力，也引来了外界的不少质疑声，方舟子转发了一条网友微博并称：16位数字开14次方取整数结果很简单的，记下就行。如果他能小数都开出来，或者让他开个3次、4次方也能开出来，算他有能耐。电视台找了一帮骗子在那里装有超能力。
方舟子的言论一出，引来了不少网友的质疑，但是绝大多数人都是持反对意见的，觉得方舟子可以怀疑，但没有权利给别人下结论，科学和人脑是一个很难用一句话说清楚的东西，它有无限中可能，虽然周玮的很多表现让人觉得不可思议，可能绝大多数人都无法做到，但不能因为个体的局限性，而否定所有人，心存质疑可以，但如果盖棺定论就要确凿的证据。
针对方舟子的疑问，《最强电脑》的节目中也给出了相应的回应：周玮所表现出来的心算能力，就跟所有的电视观众所看到的那样，现场由专家、评审出题，而且又是添加，又是修改，就是为了完美呈现他的心算能力，现场出题都是随机性的，周玮计算确实如教授所说，是运算而不是记忆。很多人关心现场周玮计算的时长，我们可以告诉大家，周玮计算每道题目的时间平均都在一分钟左右。
方舟子不仅对节目中的选手心存质疑，连科学判官魏坤琳也被他炮轰，说他是学体育的，在美国留学学的是运动控制和运动康复，和大脑认知没有办分钱关系，节目组找来伪专家蒙全国人民。质疑选手周玮是骗子，质疑科学判官魏坤琳是伪专家，甚至直言《最强大脑》是智障节目。虽然很多人选择站在方舟子的对立面，但网上仍存在很多质疑声。
此外，在后来的某一场比赛中，选手贾立平和林恺俊PK的是听音盲拧，两位选手用7分钟左右的时间观察15个模范，再通过复刻魔方转动的声音来辨别魔方编号，根据声音和规律完成复原，最后比赛结果是二比零，贾立平获胜。
当时节目播出的时候毫无争议，但是意外一段补充幕后故事的视频在网上曝光引起了争议，魔方裁判在比赛结果出来以后，判定贾立平的盲拧手法属于作弊，但也有专业人士表示他只是合理利用规则。
对于此事围棋高手柯洁也发表了言论，表示，林恺俊选手当时的愤怒可惜俺儿子，退出这个舞台是对节目公平性最有力的抗议，我支持你，节目组套路深，娱乐节目别太当真。
水哥王煜珩后来选择退赛也和节目组作假有关，王煜珩PK余奕沛，两人虽然势均力敌，都是种子选手，但水哥一战成名的光辉历史，几乎让所有人都觉得他战无不胜，两人在PK的时候，同时给了答案，但余奕沛却惊人的比水哥快很多，最终导致水哥直接退赛，有知情人士爆料，余奕沛为了这场比赛准备了很长时间，而水哥完全是临场发挥，当时水哥得知幕后黑幕之后，谴责节目组为了收视率竟然破坏比赛的规则，操纵节目。
原本以为节目组会吸取之前的教训有所收敛，但没想到会得寸进尺，今年先是三位队长队长搭档女明星受到争议，后来又有人质疑节目中越来越重视选手和嘉宾的颜值，选手的颜值决定镜头的多少，甚至节目组为了节目的效果改变赛制提前淘汰了有实力的选手。
云之队队长鲍云质疑比赛有内幕，暗指选手王易木提前得知比赛题目，并且王易木在比赛之前还扬言要第一轮晋级，没想到结果居然真的第一轮晋级，不知道是能力所在，还是节目的偏爱？此事发生之后，选手刘梦旸和张丰豪也发微博表示比赛确实不公。虽然其他选手并未对此发表意见，但在整个比赛过程中，也不难发现一些猫腻。
就比如说光影迷踪这个项目，需要选手依靠行进的小车上的灯投影在幕布上的影像来判断小车行进的路线，这道题目其实难在路线的干扰项。看过比赛的观众都知道，小车行进路线节目组一共给出了50个，并且有很多路线的相似度非常高，很多路线的细微差别需要选手把整条行驶路线看完才能区分出来。没想到王易木不仅是第一个做出来的选手，而且还只用了一分钟，很多人觉得不可思议！
稍微有常识的人都知道小车一分多钟根本走不完一圈，那么选手又是如何在这么短的时间内迅速排除如此多相似的干扰项然后迅速锁定正确答案的呢？当然，不排除运气，但是《最强大脑》要选拔出的脑力选手必须是真正有实力，有脑力的，而不是为了做出答案靠一些投机取巧。
虽然王易木是小编非常看好的一个选手，长得帅颜值高，为人还很多低调，但这毕竟是一个凭脑子说话的舞台，拼的不是颜和投机取巧，而是靠真正的实力，将来是要对抗国际战队的，怎么能因为节目效果，而埋没了真正有真才实学的脑力者。