蛋白质分子结构分为一级、二级、三级和四级结构,后三者称为高级结构和空间结构,并非所有蛋白质都有四级结构,由一条肽链组成的蛋白质只有一、二、三级结构,由两条或两条以上多肽链组成的蛋白质才可能有四级结构。
1、肽键与肽
(1)肽键:肽或蛋白质多肽链中连接两个氨基酸的酰胺称为肽键。
(2)肽:氨基酸通过肽键相连成肽。
(3)寡肽:由10个以内氨基酸相连组成的肽称为寡肽。
(4)多肽:由10个以上氨基酸相连组成的肽称多肽。
(5)蛋白质:肽链分子中的氨基酸相互连接形成的长链,称为多肽链。肽链中的氨基酸分子因脱水缩合而基团不全,称为氨基酸残基。蛋白质就是由许多氨基酸残基组成,折叠成特定的空间结构,并具有特定生物学功能的多肽,通常将含有50个以上氨基酸残基的多肽称为蛋白质,还有50个以下氨基酸残基的,仍称为多肽。如由39个氨基酸残基组成的促肾上腺皮质激素称为多肽,有51个氨基酸残基组成的胰岛素称为蛋白质。多肽链有两端,其游离α-氨基的一端称为氨基末端或N-端。游离α-羧基的一端称为羧基末端或C-端,每条多肽链中氨基酸顺序编号都是从N端开始,N端在左,C端在右。
(6)肽单元:参于肽键组成的6个原子(Cα1、C、O、N、H和Cα2)位于同一平面,Cα1和Cα2在平面上所处的位置为反式构型。此同一平面上的6个原子构成钛单元,其中,肽键的键长为0.132nm,介于C-N的单键长(0.149nm)和双链长(0.127nm)之间,所以有一定程度双链性能,不能自由旋转,而Cα分别与N和CO相连的键都是典型的单键,可以自由旋转,正是由于肽单元上Cα原子所连的两个单键可以自由旋转,决定了两个相邻肽单元平面的相对空间位置。
蛋白质分子结构分类:
1、一级结构:在蛋白质分子中,从N-端到C-端的氨基酸排列顺序称为蛋白质的一级结构,一级结构中的主要化学键是肽键,此外,有些蛋白质分子尚含有二硫键,由两个半胱氨酸羧基脱氢氧化而生成,一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。
2、二级结构:蛋白质的二级结构是指蛋白质分子中某一段肽链的局部空间构象,也就是该肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。二级结构的主要形式,包括α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲等。
3、三级结构:蛋白质的三级结构是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,也就是整条肽链所有原子的三维空间的排布位置。
4、四级结构:许多蛋白质在两条或两条以上的多肽链,肽链与肽链之间并不是通过共价相连,而是由非共价键维系,每一条多肽链都有自己完整的一级、二级和三级结构,称为亚基,亚基与亚基之间特定的三维空间排布和相互作用,称为蛋白质的四级结构。