选择好的胚胎会对提高试管婴儿的成功率起到至关重要的作用，而多数代孕的失败是由于胚胎本身染色体的异常引起的，而这些胚胎在一直前都是正常的。那么如何选择好的胚胎呢？
第一、胚胎的生长速度
胚胎的发育是精子和卵子在混合后的16-20个小时，卵子出现雌雄两个原核，24-26小时候分裂成二细胞，444-48小时为四细胞，64-72小时则为6-8细胞，105-110个小时后就会变成囊胚。我们现在进行的试管代孕婴儿的治疗，一般都在取卵后的2-3天左右进行，这时的胚胎应该是2-6细胞或者4-8细胞的，如果胚胎没有达到这个数目或者生长的过快，就是移植胚胎额种植率也会很低的。
第二、胚胎中卵裂球的形态
卵裂球的形态就是胚胎中每个细胞的大小是否一致，形状是否相似，是否相互对称。首先我们选择的就应该是大小一致、形状对称的胚胎，这些也是我们常说的优质胚胎。同样的也有人认为，可以通过观察受精后16-20小时卵子出现的雌雄两个原核的形态来判断是否是优质胚胎。
第三、胚胎中的碎片多少
许多的试管代孕婴儿中心，把碎片体积少于总体积5%的胚胎认为是最好的，25%以下都为可以用的，50%以上的都是不能进行移植的。国外有的生殖中心会通过显微操作的方式把胚胎中的碎片抽取出来，然后再进行胚胎的移植，认为这样可以提高胚胎的种植率。但是现在为止比较一致的看法还是尽量选择随便小而少的胚胎，这样的胚胎有利于移植后的成活。
还有一种情况会影响胚胎的发育，那就是夫妻染色体的异常。这样会使胚胎长到一定的阶段就停止，即使是年轻的妇女做代孕婴儿重复的失败机会也是很高的。如果在植入前能够为一个或者两个细胞做检查，就可以清理胚胎着床失败的原因。
植入正常的胚胎会增加胚胎的着床率，对要求双胞胎的会植入两个以上的胚胎也是很有助于成功的。所以选择以及胚胎，对试管代孕婴儿的成功是很重要的。
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