造成宝宝拉肚子的塬因相当多，如：婴儿无法适应所添加的副食品，吃过多含糖分的东西，吃的太饱，乳糖不耐症以及牛奶蛋白过敏症者，均会因吸收不良而产生拉肚子的现象。但是否因牛奶过敏而引起的拉肚子，家长不宜自行判断，因有许多幼儿腹泻是由于食物受到病毒或细菌污染所引起，若一昧以为是奶粉不合而更换品牌，是无法改善宝宝的腹泻情形。此外，当宝宝有肠炎，感冒，肠套叠等疾病或吃抗生素时，也是导致腹泻的因素，因此当你发现宝宝有腹泻的情形时，除送医检查诊断外，并注意宝宝是否有因拉肚子而产生脱水或体内电解质不平衡的现象。
一般而言，当腹泻达一定程度时，会使肠黏膜层受损，降低小肠黏膜酵素(尤其是乳糖酵素)的活性，而无法消化奶水中的乳糖，这些无法被分解吸收的乳糖到小肠的下半部或大肠中，被细菌发酵产生乳酸及二氧化碳，引起腹胀，腹泻等现象，使宝宝的腹泻情形更加严重。而且黏膜层为肠道中的一层天然屏障，可阻止食物中未被消化的蛋白质被吸收，所以当肠黏膜被破坏时，会使奶水中的一些较大蛋白质或过敏塬通过黏膜，进入血流中而引发过敏反应，如此恶性循环的结果将会促使宝宝的腹泻更难痊愈。
为避免乳糖及牛奶蛋白继续进入肠道中，当宝宝有严重腹泻时须暂停喂奶(包括婴儿奶粉或牛奶)，对症状较轻的婴儿可考虑将奶水冲稀一半以减轻奶水对肠膜的刺激。但对六个月内的宝宝，因其以奶水为主要的能量来源，若持续数天以稀释奶水餵食，可能会营养不良,，所以可考虑试用腹泻专用奶粉。而1-2岁以上的幼儿，家长不妨改喂稀饭或不含油的食物，不一定要喂食这种特殊配方奶粉。
