婴儿腹泻是由非感染和感染两类原因引起的。非感染性原因: 1)生理性腹泻，母乳的营养成分超过哭儿需要和消化功能的限度而使婴儿发生腹泻。 2)喂奶不当，如奶量增加太快、突然换奶(如人奶换成牛奶，牛奶换成样干粉等)、奶内加糖太多、喂奶时间变化太大以及增加辅食太快等。
3)物理因素刺激如婴儿腹部受凉、喂冷奶等。
4)消化道以外的全身性疾病如肺炎、感冒等也可以使小儿腹泻。有的疾病还会直接影响食物的吸收而造成腹泻。
感染性原因.
1)细菌感染主要是大肠杆菌和痢疾杆菌的感染。其原因很多，如牛奶污染、奶未经煮沸、奶具(如奶瓶、奶头)未能每次清洗煮烫、食用白糖污染以及吸吮手指等。夏季气候湿热，细菌容易繁殖，牛奶、水和奶具容易受到细菌污染，因此夏季发生细苗性腹泻机会比较多。同时，哭儿身体抵抗力不如儿童和成人，因此他们发生腹泻的机会要比儿童和成人多。
2)病毒感染，秋冬季经常出现婴儿腹泻的流行，这时发生的腹泻常常由病毒引起，其传播途径主要也是通过消化道的传染。
总之，婴儿腹泻是一种综合症，是由多种原因引起。婴儿发生腹泻后，应该首先查明原因，然后针对这些原因进行处理。如果是喂养不当而引起的，主要应该调整喂养，而不必应用大量抗菌药物，病毒引起的腹泻也是一样。只有细菌引起的婴儿腹泻，才是应用抗菌素的真正对象。
